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BeautifulJASONによるバッチ処理
大量のデータを扱うことは、プロセス開発からメタボロミクスまで、幅広いNMRアプリケーションで直面します。これらのスペクトルから必要な情報をいかに効率的に抽出するかは非常に重要です。このブログでは、BeautifulJASON pythonパッケージを使用して、データのディレクトリ全体を迅速に統合し、それらの積分結果をテキストファイルに抽出してさらに下流で処理する方法を説明します。 Beautiful JASONのインストール この記事のステップを実行するには、JASONのコピーとBeautifulJASON pythonパッケージが必要です。後者はpipを使って以下のコマンドでインストールできます: pip [...]
JASON 4.1が登場
JASON 4.1が登場 今回のリリースで、JASON 4.1はWindowsとmacOSの両方で「ダークテーマ」をサポートします。お使いのOSをダークモードに切り替えるだけで、JASONがダークになります! スペクトルの描画品質、ベクターグラフィックスおよびビットマップ出力に多くの改良を加えました。また、macOSでの2D等高線プロットの応答性を向上させました。さらに、macOSでのNUS処理を高速化しました。 パルスシーケンスのソースコードを、テキスト文書としてNMRパラメータとともに表示できます。 Zipアーカイブはキャンバスにドラッグ&ドロップするだけです。JASONは、開くことができるすべてのファイルを自動的に解凍します! 分子内の原子にはカスタムラベルを付けることができます。こうすることで、必要に応じて原子の [...]
JASON Version 4.0
JASONチームがJASONバージョン4.0をリリース JASONバージョン4.0では、多くの分野で改良が加えられています。リファレンスデコンボリューション処理を導入し、この強力なツールの簡単なアプリケーションを提供します。1次元NMRスペクトルのピーク解析は、フィッティングパラメータを固定できるようになり、解析のコントロールがさらに向上しました。チャートは、NMRスペクトルと同様に、ズームとパンのためのマウスモードにより、より簡単にナビゲートできるようになりました。 夏が近づくにつれ、“リラクゼーション”について考え始める良い時期ですが、JASONも例外ではありません!リラクゼーション実験用のROSY処理を強化し、T2実験や飽和回復実験に対応できるようになりました。また、カラー・グラデーション・オプションに加え、スタックされたデータを単一色で表示するオプションも追加されました。 アノテーション、ルール、テーブルなどについても複数の改良が加えられました。いつものように、ユーザビリティとパフォーマンスのためにいくつかの内部改良を行い、いくつかの厄介なバグを潰しました。 これらの改良点の詳細を見てみましょう: アレイ測定と緩和解析 CPMG T2 [...]