最近の投稿 BeautifulJASONによるバッチ処理 - JEOL JASON , において、JASONとpythonパッケージBeautifulJASONを使って、NMRデータ処理を自動化する方法について説明しました。このブログでは、一歩離れて、コマンドラインから直接JASONを呼び出すだけで利用できる簡単な自動化機能のいくつかを紹介します。 環境の設定 コマンドラインからJASONを簡単に使用するには、JASON実行ファイルの場所をパスに追加する必要があります。Windows上では、コントロールパネルからシステム環境編集の編集を開きpath変数を編集し、macOS上では、PATH環境変数にJASONを追加するか、 [...]
2025年のJASON 5.0へようこそ！ 2025年を迎えるにあたり、JASONは新しいバージョン番号システムを導入しました。年間を通して、リリースの内容や間隔に変更はありません。以下はその説明です： 分子構造： JASONバージョン5.0では、分子構造作成エンジンが強化されました！明示的に分子内の水素の追加/削除ができるようになりました、平坦な2D分子を3Dに変換する, SMILESとInChI表現から分子を作成する, ChemDrawファイルの読み込みなど。リンク先のビデオで、その方法をご覧ください。 [...]
品質管理で一般的に必要とされる同じ種類のサンプルの繰り返し分析は、面倒で時間がかかります。BeautifulJASONは、これらの作業を完全に自動化できるほど高速化するフレームワークを提供します。スチレンブタジエンゴム（SBR）のサンプル例で説明します。 SBRは最も広く使用されている合成ゴムで、ブタジエンとスチレンの共重合によって製造できます。スチレン／ブタジエンの比率はポリマーの特性に影響し、スチレン含有量が高いほど、ゴムは硬くなり、ゴムらしさが失われるます。したがって、この共重合体の組成を評価することが重要であり、NMRはこの作業に適しています。実際、ISO 21561-1には、溶液重合SBR中のブタジエンの微細構造とスチレンの含有量をプロトンNMRで定量的に決定する手順が説明されています。これは、図1および表1に示すように、SBRスペクトルから積分を抽出することを採用しています。 図1：SBR試料と積分範囲の例 表1： 信号統合エリアの定義 積分Cには溶媒も含まれるため、この方法ではブランクサンプルの溶媒の積分を取得し、積分Cから差し引くことを提案しています： そして、ブタジエン部分の各微細構造成分（トランス、シス、ビニル）の含有量とスチレン含有量は、以下のように計算されます： BeautifulJASONでは、このすべてを自動化することができます。スクリプトを実行するだけで自動的に積分して含量を計算し、レポートを生成することができます： これを行うにはまず積分範囲を定義する必要があります。この場合、自動積分ではなく手動積分を実施します。JASONでデータセットを開き、iキーを押します（または、選択したスペクトルの左上にあるコンテキストツールバーの積分モードボタンを左クリックする）。次にマウスの左ボタンを押したまま、カーソルを水平にドラッグ＆ドロップして積分領域を定義し、関心のある領域を積分します。これを各積分領域で繰り返します。積分バーをダブルクリックすると、積分プロパティダイアログが開き、積分領域をより正確に定義することができます。 [...]
最新のJEOL NMR装置に付属しているソフトウェアでは、システムがどのように使用されたかを管理者が評価することができます。JEOL Delta ver.5およびDelta ver.6ソフトウェアは、異なるユーザーに使用料を請求する必要がある場合でも、特定の測定を実行するためにどれだけの装置時間を費やしたかを評価したい場合でも、詳細な情報を提供し、装置時間を要約し、課金率が割り当て、各ユーザーにいくら請求するかを直接報告することができます。 しかし、すべてのプログラムがそのようなツールを提供しているわけではありません。例えば、20年以上前にリリースされたDelta ver.4は、いまだに多くの日本電子の旧システムで動作していますが、そのようなツールは提供されていません。しかし、console.log と呼ばれる、装置が何をしていたかのログは出力されます。このログには、装置の動作に関する詳細情報がたくさん含まれています。では、各測定でどれくらいの時間が費やされたかという情報を抽出するにはどうすればよいのでしょうか？そのためには、ログから関連する行を抽出するスクリプトを使えばよいです。Pythonは科学界で広く使われているスクリプト言語であり、JASONは必要に応じてPythonスクリプトを直接実行することができます。このようなスクリプトは、使い慣れたプログラミング言語で作成することができます。 [...]