BeautifulJASONによる品質管理：スチレンブタジエンゴムの自動分析
品質管理で一般的に必要とされる同じ種類のサンプルの繰り返し分析は、面倒で時間がかかります。BeautifulJASONは、これらの作業を完全に自動化できるほど高速化するフレームワークを提供します。スチレンブタジエンゴム（SBR）のサンプル例で説明します。 SBRは最も広く使用されている合成ゴムで、ブタジエンとスチレンの共重合によって製造できます。スチレン／ブタジエンの比率はポリマーの特性に影響し、スチレン含有量が高いほど、ゴムは硬くなり、ゴムらしさが失われるます。したがって、この共重合体の組成を評価することが重要であり、NMRはこの作業に適しています。実際、ISO 21561-1には、溶液重合SBR中のブタジエンの微細構造とスチレンの含有量をプロトンNMRで定量的に決定する手順が説明されています。これは、図1および表1に示すように、SBRスペクトルから積分を抽出することを採用しています。 図1：SBR試料と積分範囲の例 表1： 信号統合エリアの定義 積分Cには溶媒も含まれるため、この方法ではブランクサンプルの溶媒の積分を取得し、積分Cから差し引くことを提案しています： そして、ブタジエン部分の各微細構造成分（トランス、シス、ビニル）の含有量とスチレン含有量は、以下のように計算されます： BeautifulJASONでは、このすべてを自動化することができます。スクリプトを実行するだけで自動的に積分して含量を計算し、レポートを生成することができます： これを行うにはまず積分範囲を定義する必要があります。この場合、自動積分ではなく手動積分を実施します。JASONでデータセットを開き、iキーを押します（または、選択したスペクトルの左上にあるコンテキストツールバーの積分モードボタンを左クリックする）。次にマウスの左ボタンを押したまま、カーソルを水平にドラッグ＆ドロップして積分領域を定義し、関心のある領域を積分します。これを各積分領域で繰り返します。積分バーをダブルクリックすると、積分プロパティダイアログが開き、積分領域をより正確に定義することができます。 [...]
BeautifulJASONによるバッチ処理
大量のデータを扱うことは、プロセス開発からメタボロミクスまで、幅広いNMRアプリケーションで直面します。これらのスペクトルから必要な情報をいかに効率的に抽出するかは非常に重要です。このブログでは、BeautifulJASON pythonパッケージを使用して、データのディレクトリ全体を迅速に統合し、それらの積分結果をテキストファイルに抽出してさらに下流で処理する方法を説明します。 Beautiful JASONのインストール この記事のステップを実行するには、JASONのコピーとBeautifulJASON pythonパッケージが必要です。後者はpipを使って以下のコマンドでインストールできます： pip install beautifuljason [...]
JASON 4.1が登場
JASON 4.1が登場 今回のリリースで、JASON 4.1はWindowsとmacOSの両方で「ダークテーマ」をサポートします。お使いのOSをダークモードに切り替えるだけで、JASONがダークになります！ スペクトルの描画品質、ベクターグラフィックスおよびビットマップ出力に多くの改良を加えました。また、macOSでの2D等高線プロットの応答性を向上させました。さらに、macOSでのNUS処理を高速化しました。 パルスシーケンスのソースコードを、テキスト文書としてNMRパラメータとともに表示できます。 Zipアーカイブはキャンバスにドラッグ＆ドロップするだけです。JASONは、開くことができるすべてのファイルを自動的に解凍します！ 分子内の原子にはカスタムラベルを付けることができます。こうすることで、必要に応じて原子の 「番号変更」や「マーク付け」を行うことができようになりました。 SMILEQをさらに高速化し、レポートエディターを追加しました。 [...]
JASON Version 4.0
JASONチームがJASONバージョン4.0をリリース JASONバージョン4.0では、多くの分野で改良が加えられています。リファレンスデコンボリューション処理を導入し、この強力なツールの簡単なアプリケーションを提供します。1次元NMRスペクトルのピーク解析は、フィッティングパラメータを固定できるようになり、解析のコントロールがさらに向上しました。チャートは、NMRスペクトルと同様に、ズームとパンのためのマウスモードにより、より簡単にナビゲートできるようになりました。 夏が近づくにつれ、“リラクゼーション”について考え始める良い時期ですが、JASONも例外ではありません！リラクゼーション実験用のROSY処理を強化し、T2実験や飽和回復実験に対応できるようになりました。また、カラー・グラデーション・オプションに加え、スタックされたデータを単一色で表示するオプションも追加されました。 アノテーション、ルール、テーブルなどについても複数の改良が加えられました。いつものように、ユーザビリティとパフォーマンスのためにいくつかの内部改良を行い、いくつかの厄介なバグを潰しました。 これらの改良点の詳細を見てみましょう： アレイ測定と緩和解析 CPMG T2 および T1 [...]
JASONにおけるNMRデータ処理：ROSY
最近、 JASON 3.2 で緩和データの便利な処理と解析が導入されました。このコンセプトは拡散NMRやDOSYのサポートに似ています。解析には積分、ピーク、またはすべてのデータポイントを使用することができ、ROSY（Relaxation Ordered SpectroscopY）プロットは結果のT1値とそれぞれの推定誤差から構築されます。JASON 3.2では、ROSY処理機能はインバージョンリカバリー、T1実験のみをサポートしていますが、近日中に他のあらゆる一般的な手法に拡張される予定です。ユーザー定義の方程式による積分のフィッティングを含むあらゆる配列実験のマニュアル解析は、すでにJASONに実装されています。DOSYと同様の処理ステップとしてROSYを実装した目的は、ユーザーエクスペリエンスを向上させ、データ処理エンジンによるより良い自動化を可能にすることです。 図1 JASONにおけるインバージョンリカバリー（T1）実験の解析と処理 [...]
JASONバージョン3.2は、JASONチームによる2024年の最初のリリースです。
JASONバージョン3.2は、JASONチームによる2024年の最初のリリースです。 JASON 3.2では、NMRとともに質量分析データも追加できるようになりました。JEOL JMS-S3000 SpiralTOF（MALDI-TOFMS） のユーザーは、JASONにデータを読み込むことができるようになり、JEOL JMS-S3000 SpiralTOF の質量分析(MS)データをパラメータとピークの簡単なレポートと一緒に表示することができます。 [...]