最近、 JASON 3.2 で緩和データの便利な処理と解析が導入されました。このコンセプトは拡散NMRやDOSYのサポートに似ています。解析には積分、ピーク、またはすべてのデータポイントを使用することができ、ROSY(Relaxation Ordered SpectroscopY)プロットは結果のT1値とそれぞれの推定誤差から構築されます。JASON 3.2では、ROSY処理機能はインバージョンリカバリー、T1実験のみをサポートしていますが、近日中に他のあらゆる一般的な手法に拡張される予定です。ユーザー定義の方程式による積分のフィッティングを含むあらゆる配列実験のマニュアル解析は、すでにJASONに実装されています。DOSYと同様の処理ステップとしてROSYを実装した目的は、ユーザーエクスペリエンスを向上させ、データ処理エンジンによるより良い自動化を可能にすることです。
パラメータ一覧
ここでは、 JASON 3.2 で実装された全てのパラメータのリストを説明します。通常通り、JASON処理テンプレートファイル(.jjp)内のそれぞれの順番で記載されておりますが、GUI上の見た目とは異なる場合があります。
- “Shortest T1” 2D ROSYでプロットする最短緩和時間(単位は秒)を設定します。
- “Longest T1” 2D ROSYでプロットする最長緩和時間(単位は秒)を設定します。
- “Array list” は、Jason_parameters に内部的に格納されている変数遅延リストのキーの名前です。このパラメータは正しく初期化されない場合があります。‡ ‡.
- “Digitisation” は、ROSYプロットを構築するための緩和時間領域のポイント数です。これは変数遅延リストの要素数とは関係ありません。非常に大きな値(>4000)は、より多くのメモリ、ディスクスペースを消費し、GUIの応答を遅くします。DOSYと同様に、より高い解像度でプロットするために、関連する領域を「ズーム」することを検討してください。水平投影と垂直投影の両方が、緩和領域の桁数不足に敏感であることに注意してください。
- “Use” では、積分、ピークハイト、全データポイントのいずれかを選択できます。最も包括的に開発されたフレームワークであるため、積分の使用が好ましいです。ピーク高さを使用する場合、ピーク位置は自動的に設定されます。積分を使用する場合、生のT1データのスタックビューは積分領域の視覚化に役立ち、それらは制限なく設定ます。”全データポイント “オプションは、処理リストの直接次元部分の最後に適用されるShrink(またはResample)と一緒に使用することを推奨します。各ポイントは個別にフィッティングされるため、このモードで非常に多くのポイントを使用すると、処理が極端に遅くなることがあります。
- “Basic mode” または “Expert mode” ROSY処理ウィジェットを展開したときに、いくつかのパラメータのみ、またはすべてのパラメータを表示するようにインターフェイスを切り替えます。現在は実装されておらず、すべてのパラメータにアクセス可能ですが、より多くの実験をサポートするための拡張では、簡素化されたインターフェイスを提供するために、これも導入する予定です。
- “Relaxation” オプションは “時間” です。次のリリース(JASON 4.0)では、結果を緩和時間または緩和率として提供するオプションを導入する予定です。
‡ JASON 3.2のリリースでは、オリジナルのベンダーパラメータを解釈して関連パラメータが自動的に初期化されるDOSYとは異なり、パラメータの自動設定はありません。全てのベンダーフォーマットのデフォルト実験をサポートするための開発は進行中であり、リリースされ次第、この記事を更新します。